杨森可视化和处理R服务
杨森可视化和处理R服务
扎克SchleienITLDP分析师，强生公司业务技术负责人
关爱世界，一次关爱一个人，激励并团结了强生的全体员工。强生Janssen制药公司的研发新兴技术团队的使命是促进计算和数据科学家的范式转变，部署具有无限计算能力的可扩展平台解决方案。通过拥抱创新和加强合作，他们努力实现突破，帮助世界各地的人们活得更长、更健康、更幸福。
“詹森全球流行病学部门使用R和Shiny建立了一个工具，利用ClinicalTrials.gov的数据进行网络元分析。”
——ITLDP分析师、商业技术领袖扎克·施莱恩强生公司
所面临的挑战
当Janssen的科学家能够轻松地共享代码和应用程序，并与同事协作时，他们的效率是最高的。他们希望在R中进行分析，开发Shiny应用程序以与强生的其他科学家和业务同事共享，并将R批处理作业提交给HPC集群。传统的RStudio S英格兰vs伊朗让球erver和Shiny环境采用单节点设置，它们之间有一个共享驱动器来存储R包和托管Shiny应用程序。然而，该团队确定，这种设置不能很好地扩展对计算或内存的需求。
解决方案
新兴技术团队专注于高性能计算(HPC)和弹性云计算。他们开发了RSVP:可视化和处理R服务。简单地说，它是作为服务的R。RSVP为整个Janssen的科学家提供了一个健壮的R/Shiny计算环境。
强生利用亚马逊网络服务(AWS)，并在现场设立了一个指定的虚拟私有云团队(VPCx)。新兴技术团队构建了一个集群环境，其中包含一个主节点、任意数量的个人节点和一个突发计算网格，以满足按需“令人尴尬的并行”计算能力。闪亮的服务器支持和RSt英格兰vs伊朗让球udio位于主节点上。一旦用户加入这个环境并创建一个文件夹来存储他们的Shiny应用程序，他们就会看到一个RStudio GUI，并且能够从他们的主文件夹中运行Shiny应用程序。英格兰vs伊朗让球
为什么R英格兰vs伊朗让球Studio ?
英格兰vs伊朗让球RStudio闪亮服务器专业版RStu英格兰vs伊朗让球dio Server为科学家提供了正确的工具，并补充了团队在集群和Chef方面的背景，允许他们根据需要扩展和增强环境。当需要进行增强时，只需对Chef烹饪书进行最少的工作。
在此之前，詹森的科学家们经常不得不使用第二台计算机来进行R分析，因为他们的工作在一台笔记本电脑上消耗了太多的计算能力。例如，一位科学家花了2.5天的时间进行分析，进行特征选择和排列测试预测阿尔茨海默病风险的标记。RSVP中英格兰vs伊朗让球有了RStudio和Shiny Server Pro，启动RStudio和更新他的应用程序的时间缩短到了半天!
回报
强生公司的多个团队现在都在使用RSVP服务。综合解决方案团队的科学家们正在建立模型，以帮助预测精神分裂症的复发。杨森全球流行病学部门使用R和Shiny建立了一个工具，利用ClinicalTrials.gov的数据进行网络元分析。
科学家们常常被囿于组织结构。通过RSVP和Slack等应用程序，新兴技术团队使杨森内部的科学家能够与即时网络之外的同事分享和协作。这对Shiny社区的发展非常有帮助，但更重要的是，它允许玩家交流想法。团队继续与RStudio合作，培养更多Shiny在药物开发中的应英格兰vs伊朗让球用，并将Shiny和R Markdown结合起来进行交互式和可重复性分析。
英格兰vs伊朗让球RStudio为使用R和Python的数据科学团队提供了开源和企业级的专业软件。