R在药物发现、研究和开发中的作用

将一种新分子推向市场所需的分析需要数百名定量科学家的集体努力,他们的培训、工具和工作流程都非常多样化。

R在药物发现、研究和开发中的作用

2019年7月18日

将一种新分子推向市场所需的分析需要数百名定量科学家的集体努力,他们的培训、工具和工作流程都非常多样化。在本次演讲中,来自罗氏/基因泰克的演讲者将讨论R在制药生命周期的不同阶段的不同使用方式,从研究和发现,到开发和市场准入。

第1部分:使用内部和开放源码实现协作软件开发

迈克尔·劳伦斯-基因泰克研究和早期开发科学家

为了适应快速变化的科学需求,需要跨企业、行业和领域的协作软件开发。开放和内部源代码的原则提供了一个有效的协作模型,通过分散的、自下而上的参与打破了竖井。我们将提出一个在传统企业结构中容纳基层发展的框架。

第2部分:使用Shiny进行自助统计

塞巴斯蒂安沃尔夫-科学软件开发人员,罗氏诊断

罗氏诊断公司的质量保证过程依赖于统计评估。由于这种评估遵循一定的标准操作程序,生物统计部门决定让用户自己进行评估。R-Shiny应用bioWARP为不会编写R-Shiny的人提供了诸如线性回归或等价测试等标准程序。它为他们节省了咨询生物统计学家或使用经过验证的Excel表格的时间。

第三部分:用R分析临床试验数据进行决策和法规提交

Adrian Waddell -罗氏制药的数据分析师

使用R生成提交给卫生当局的临床试验数据分析结果需要一个完整的工具、流程和环境生态系统。在罗氏,我们目前正在开发这样一个生态系统,在这次演讲中,我将介绍它的一些组成部分。这些包括:一套基于r的工具,专门创建表、清单和图(tlg);一个框架,用于创建自定义交互式web应用程序,使用shiny进行探索性分析,支持动态子集设置并提供tlg的可重复性。卡塔尔世界杯欧洲预选赛赛程表此外,我将展示一个概念验证项目,该项目用于简化数据集和tlg的创建,以供卫生当局提交。

第4部分:建立数据科学团队,实现个性化医疗保健(PHC)

James Black -罗氏制药公司个人医疗保健数据科学副总监

以Tidyverse为模型,罗氏/基因泰克建立了一套环环相扣的软件包,从我们的分析中抽象基础设施和重复,以及支撑这个生态系统的共同哲学。我们还将讨论如何将这些包集成到包含元数据收集、版本控制代码和统一在线结果门户的工作流中。最后,我们将分享我们的经验,包括积极的和消极的,介绍这个新的工作流程以及它所带来的文化和能力的转变。